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應(yīng)用案例

北大游富平教授團隊在CELL子刊發(fā)表論文:將SA磁珠應(yīng)用于鄰近標(biāo)記技術(shù)

利用鄰近標(biāo)記技術(shù),BeaverBeads? Streptavidin (Cat# 22305) 磁珠捕獲目的蛋白,結(jié)合質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),驗證線粒體蛋白ERAL1參與抗RNA病毒固有免疫調(diào)控。

摘要:利用鄰近標(biāo)記技術(shù),BeaverBeads? Streptavidin(22305)磁珠捕獲目的蛋白,結(jié)合質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),驗證線粒體蛋白ERAL1參與抗RNA病毒固有免疫調(diào)控。

Fig 1. Graphical Abstract

 

2021年1月20日,北京大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究所游富平教授團隊在Cell Press細(xì)胞出版社旗下期刊Cell Reports(IF=8.95)發(fā)表研究論文,該研究利用鄰近標(biāo)記技術(shù),直接在活細(xì)胞中標(biāo)記生物素,在細(xì)胞裂解液中加入BeaverBeads? Streptavidin(22305)磁珠,富集生物素化蛋白,結(jié)合質(zhì)譜分析,發(fā)現(xiàn)了在仙臺病毒(SeV)感染后與線粒體外膜蛋白MAVS高親和力相互作用的蛋白ERAL1,驗證了線粒體蛋白ERAL1參與抗RNA病毒固有免疫調(diào)控。

Fig 2. Flow chart for MAVS-TurboID proximity-based labeling technology. ERAL1 was identified as a MAVS-interacting protein by mass spectrometry.

 

線粒體是天然免疫反應(yīng)的中心。線粒體上的關(guān)鍵分子MAVS是抗病毒RLR通路信號傳遞的平臺,目前已有多項研究發(fā)現(xiàn)線粒體可以釋放核酸(DNA和RNA), 以激活免疫反應(yīng)。但線粒體蛋白是否被釋放出來參與天然免疫反應(yīng)目前鮮有報道。游教授團隊發(fā)現(xiàn),利用鄰近標(biāo)記技術(shù),直接在活細(xì)胞中標(biāo)記生物素,在細(xì)胞裂解液中加入BeaverBeads? Streptavidin磁珠,富集生物素化蛋白,結(jié)合質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn),細(xì)胞受到仙臺病毒(SeV)感染后,線粒體外膜會發(fā)生通透性改變,ERAL1蛋白被釋放到細(xì)胞質(zhì)中,與線粒體膜蛋白MAVS結(jié)合,從而參與抗病毒RLR通路信號傳遞,同時鄰近標(biāo)記技術(shù)還發(fā)現(xiàn),ERAL1也可以與E3泛素連接酶TRIM25互作,通過依賴TRIM25的方式正向調(diào)控抗病毒RLR信號通路。綜合顯示,病毒感染條件下,線粒體不僅可以釋放核酸,激活免疫反應(yīng),也可通過釋放蛋白介導(dǎo)固有免疫反應(yīng),提示線粒體在固有免疫調(diào)控中的重要作用。

參考文獻(xiàn):The mitochondrial protein ERAL1 suppresses RNA virus infection by facilitating RIG-I-like receptor signaling


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