【Oligo (dT)磁珠】mRNA純化好幫手
Oligo dT磁珠上市啦!
目前,隨著FDA批準了美國公司Moderna研發(fā)的新冠肺炎疫苗mRNA-1273的緊急使用授權(quán),基于mRNA的治療方法越來越引起大家的興趣,基于mRNA的研究也越來越多,所以,如何獲得純度高,質(zhì)量高的mRNA越來越受到人們的關(guān)注。
真核細胞的mRNA是單順反子,其最顯著的特征是具有5'端帽子結(jié)構(gòu)和3'端的poly A的結(jié)構(gòu),此poly A結(jié)構(gòu)為mRNA的提取提供了有效的途徑,人們利用堿基配對原理,開發(fā)出寡聚(dT)纖維素或寡聚(U)瓊脂糖親和柱分離mRNA的方法,近幾年,mRNA的提取方法又有所改進和突破,其中就有mRNA的磁珠分離純化方法。該技術(shù)主要包含2種方法,其一是用生物素標記的Oligo(dT)與mRNA3'端的poly A退火形成雜交體,然后用帶有鏈霉親和素的順磁磁珠洗滌并捕獲雜交體,形成雜交體-磁珠復合體,最后用磁架將此復合體捕獲;其二是直接用Oligo(dT)磁珠捕獲樣本中的mRNA,進一步用無RNase無菌水洗滌,即可獲得純化的mRNA。
接下來,Dr. BEAVER就給大家介紹下1. Oligo dT磁珠的工作原理及應用。
1. Oligo dT磁珠的工作原理及應用
Oligo dT磁珠是一種表面共修飾了寡聚dT序列,利用磁珠表面的寡聚dT序列可以和mRNA的polyA尾之間的堿基配對,因此可以從真核總RNA或者細胞、動植物組織等多種樣本中快速分離純度高且完整的mRNA。經(jīng)Oligo dT磁珠純化的mRNA,可應用于RT-PCR, 固相cDNA文庫構(gòu)建、二代測序、Northern Blot分析、引物延伸、基因表達分析、RACE、RNA測序、親和純化、微陣列、cDNA微陣列、S1核酸酶分析、核糖體酸酶保護測定等分子生物學實驗,還可進行mRNA疫苗的研究等。
2. 國產(chǎn)品牌的崛起
海貍公司專注于納米磁珠技術(shù)和產(chǎn)品開發(fā)。公司10年來,技術(shù)不斷迭代,已經(jīng)完成了第一代蛋白分離純化磁珠、第二代核酸純化磁珠及第三代免疫檢測磁珠的研發(fā)和規(guī)模化生產(chǎn)。海貍技術(shù)團隊經(jīng)過2年多的研發(fā)和驗證,推出BeaverBeads Oligo (dT)磁珠,可用于mRNA的純化。
BeaverBeads Oligo (dT)產(chǎn)品特點:
a) 表面活性位點豐富,mRNA捕獲效率高
b) 非特異性吸附低,mRNA純度高
c) 粒徑均一,懸浮性好,沉降速率低
d) 磁響應時間短,可適用于自動化操作
e) 工業(yè)化規(guī)模生產(chǎn),批次穩(wěn)定
應用案例一:
樣本:人細胞Total RNA
上樣量:300ng Total RNA
磁珠用量:20-50μL
實驗結(jié)果:
靶標 | 磁珠 | Mean Ct |
GAPDH mRNA | 進口品牌D | 22.56 |
BEAVER | 22.62 | |
18S rRNA | 進口品牌D | 26.06 |
BEAVER | 26.19 |
實驗操作過程中,BeaverBeads Oligo (dT)磁珠的懸浮性與進口品牌D相當。從人細胞total RNA樣本中純化mRNA,采用熒光定量PCR對樣本進行定量檢測,對mRNA(特異性)和sRNA(非特異性)檢測的Ct值偏差<0.1,兩品牌磁珠無明顯差異。
應用案例二:
樣本:植物Total RNA
上樣量:600ng Total RNA
磁珠用量:20-50μL
實驗結(jié)果:
靶標 | 磁珠 | Mean Ct |
GAPDH mRNA | 進口品牌D | 22.63 |
BEAVER | 22.68 | |
18S rRNA | 進口品牌D | 26.04 |
BEAVER | 25.91 |
實驗結(jié)論:BeaverBeads Oligo (dT)磁珠,懸浮性與進口品牌D相當,從植物的total RNA樣本中純化mRNA,采用熒光定量PCR對樣本進行定量檢測,對mRNA(特異性)和sRNA(非特異性)檢測的Ct值偏差<0.15,兩品牌磁珠無明顯差異。
產(chǎn)品信息:
產(chǎn)品名稱 | BeaverBeads Oligo (dT) | |
貨號 | 70430 | 70431 |
粒徑 | 2.8 μm | 1 μm |
mRNA結(jié)合量 | 1-2 μg/mg磁珠 | |
磁珠濃度 | 5mg/mL | |
保存溶液 | 1×PBS,0.1%(v/v)proclin-300 | |
保存條件 | 2~8℃ | |
保質(zhì)期 | 2年 | |
適用樣本類型 | 總RNA、 粗細胞樣本、動物組織、植物組織等。 |
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