磁珠法核酸提取 ——可提取低至100拷貝/mL病毒的核酸
隨著分子生物學(xué)技術(shù)的高速發(fā)展,以核酸雜交、核酸擴(kuò)增及核酸序列分析為代表的分子診斷和檢測(cè)技術(shù)在諸多領(lǐng)域中日益凸顯出至關(guān)重要的作用。樣本處理為分子診斷實(shí)驗(yàn)的“第一步”,也是最關(guān)鍵的一步,其獲得的核酸質(zhì)量的優(yōu)劣將直接影響到下游分子生物學(xué)試驗(yàn)的成敗。全球爆發(fā)的新冠病毒,促使了核酸檢測(cè)市場(chǎng)的暴增,整個(gè)疫情期間國(guó)內(nèi)的核酸檢測(cè)市場(chǎng)將超過(guò)400億。
核酸提取傳統(tǒng)方法
傳統(tǒng)的提取方法主要有:酚/氯仿抽提法、醇沉淀、親和層析柱、密度梯度離心和硅膠柱法。這些傳統(tǒng)提取方法可從不同組織樣本中分離出DNA和RNA,但這些技術(shù)中包含沉淀和離心等操作步驟,其所需的生物樣本量較大,提取步驟較為繁雜、費(fèi)時(shí)費(fèi)力,得率也不高,難以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化操作,另外,大部分的傳統(tǒng)方法中還需要用到有毒化學(xué)試劑,對(duì)操作人員的健康具有潛在危害,因此,伴隨著分子生物學(xué)以及材料學(xué)的發(fā)展,采用磁珠的方法從液相系統(tǒng)中分離純化核酸的新方法已經(jīng)崛起。
磁珠法分離核酸的原理
納米磁珠是高分子材料或者生物分子包被四氧化三鐵核心而形成的,可以被磁鐵吸附的同時(shí)納米小球。用于核酸純化的磁珠表面功能基團(tuán)一般為(OH)和羧基(COOH)。
磁珠分離核酸核心技術(shù)是固相可逆固定化技術(shù),但磁珠和核酸具體是如果相互作用吸附在一起,目前還不是很清楚,鹽橋理論是其中猜想之一。在利用磁珠結(jié)合核酸的體系中,由于緩沖液的作用核酸分子(DNA & RNA)會(huì)由線性變成球狀,暴露出核酸骨架上大量的負(fù)電基團(tuán)與反應(yīng)體系中的陽(yáng)離子連接,在磁珠外層負(fù)電基團(tuán)的作用下,形成“陰離子-陽(yáng)離子-陰離子”的鹽橋結(jié)構(gòu),使核酸分子被特異性地吸附到磁珠表面。而當(dāng)反應(yīng)緩沖液被棄除后,加入水性分子,會(huì)快速充分水化核酸分子,解除三者之間的離子相互作用,使吸附到磁珠上的核酸分子被純化出來(lái)。
海貍核酸提取磁珠
磁珠法核酸提取是納米科技與生物技術(shù)的完美結(jié)合。納米磁珠由于尺寸小,具有超大的比表面積。利用納米技術(shù)對(duì)磁珠表面進(jìn)行修飾,使磁珠表面具有更多核酸結(jié)合位點(diǎn),從提高了納米磁珠對(duì)核酸提取回收效率和靈敏度。
海貍核酸提取具有如下特點(diǎn):
1. 磁珠生產(chǎn)工藝控制嚴(yán)格。每顆磁珠都呈現(xiàn)規(guī)整的球形,以保證低豐度樣本提取的穩(wěn)定性。
2. 磁珠表面特殊化處理,可實(shí)現(xiàn)DNA/RNA共提取。
3. 同樣適合低豐度樣本,包括游離DNA,病毒DNA和RNA。
4. 產(chǎn)能穩(wěn)定,月產(chǎn)能可達(dá)10kg。
5. 批次穩(wěn)定,不同批次核酸提取效率CV<10%。
6. 可實(shí)現(xiàn)高通量和自動(dòng)化操作,配合核酸提取儀最快可實(shí)現(xiàn)9min提取。
最低可提取100拷貝/mL病毒的RNA
2020年12月30日,國(guó)家衛(wèi)健委發(fā)布的《醫(yī)療機(jī)構(gòu)新冠病毒核酸檢測(cè)工作手冊(cè)(試行第二版)》中在性能驗(yàn)證一項(xiàng)明確要求“在用于臨床標(biāo)本檢測(cè)前,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對(duì)由提取試劑、提取儀、擴(kuò)增試劑、擴(kuò)增儀等組成檢測(cè)系統(tǒng)進(jìn)行必要的性能驗(yàn)證,性能指標(biāo)包括但不限于精密度(至少要有重復(fù)性)和最低檢測(cè)限。建議選用高靈敏的試劑(檢測(cè)限≤500拷貝/ml)。”國(guó)內(nèi)新冠病毒檢測(cè)試劑盒的靈敏度大部分布在200-1000拷貝/mL之間。核酸提取的靈敏度是病毒檢測(cè)試劑盒靈敏度的關(guān)鍵,提高核酸提取試劑盒的靈敏度高可以大大提高病毒檢測(cè)的準(zhǔn)確性。
表1:采用海貍磁珠進(jìn)行新冠假病毒保存液(病毒濃度為100拷貝/mL)核酸提取的檢測(cè)數(shù)據(jù)。
品牌 | BEAVER | 對(duì)照 |
Ct | 34.81 | 35.47 |
取200μL新冠假病毒保存液(病毒濃度為100拷貝/mL),利用海貍磁珠進(jìn)行病毒核酸提取,RT-qPCR檢測(cè)獲得核酸的濃度,其Ct值為34.81,比競(jìng)品提前0.66。即,海貍磁珠可提取低至20個(gè)拷貝的病毒核酸。
相關(guān)產(chǎn)品
英文名稱 | 中文名稱 | 貨號(hào) | 型號(hào) |
BeaverBeads Mag OH-500 | 二氧化硅羥基磁珠500nm | 70301 | 10 mg/mL,500 nm |
BeaverBeads Mag OH-1000 | 二氧化硅羥基磁珠1μm | 70302 | 10 mg/mL,1000 nm |
BeaverBeads Mag COOH-S500 | 二氧化硅羧基磁珠S500 | 70107 | 510 mg/mL,500nm |
BeaverBeads Mag COOH-NS500 | 二氧化硅羧基磁珠NS500 | 70108 | 10 mg/mL,500nm |
BeaverBeads? Mag COOH-PC300 | 二氧化硅羧基磁珠(300nm) | 70111 | 50mg/mL,300nm |
BeaverBeads? Mag COOH-SC300 | 二氧化硅羧基磁珠(300nm) | 70112 | 50mg/mL,300nm |
BeaverBeads Mag COOH | 羧基磁珠(300nm) | 70106 | 10 mg/mL,300 nm |